Através do botão de notificação é possível desabilita-las, evitando assim que as mesmas apareçam mesmo quando o sistema estiver minimizado.
Para isso, clique sobre o ícone de alerta conforme imagem abaixo:
Ao seleciona-lo, clique com o botão direito sobre a tela de notificação e selecione a opção Configurações, conforme exemplo abaixo:
Clique na opção Ativar Alertas e o sistema permitirá que o usuário informe apenas as notificações necessárias ou desabilite todas, conforme mostra imagem abaixo:
Para finalizar e validar a operação clique em Confirmar.